南方医院增城院区由南方医科大学南方医院与广州市增城区人民政府按照三级甲等综合医院标准合作共建，是南方医院“双主院区”发展战略的核心组成部分，按照与院本部同等综合水平的目标建设，与院本部实行一体化管理。

院区一期工程建筑面积8.35万平方米，开放床位516张，开设临床科室33个，配置飞秒激光手术系统、256排CT、3.0T MR、DSA、ECMO等高端设备。科室主任、护士长及多数技术骨干均由院本部直接派驻，现有员工1000人，其中高级职称专家109人，博士及硕士246人。先后获评国家高级卒中中心、国家级胸痛中心，以及广东省创伤救治科研中心骨科临床基地、广州市V类妊娠监护助产机构，同时承担增城南部创伤中心、危重症孕产妇和新生儿救治中心等多项职能，被指定为广州市道路交通事故急危重症伤员救治工作指定医院。

院区二期工程（在建）总建筑面积20.19万平方米，规划新增床位900张，引入质子放射治疗系统、高能直线加速器、腹腔内窥镜手术机器人、DSA+CT 复合手术室、PET/CT、SPECT/CT等尖端医学装备，新增血液科、放疗科及核医学科。未来，院区将围绕“一平台、三中心、一园区”的建设规划，打造急危重症一体化救治平台，肿瘤综合诊疗中心、血液病诊疗中心、眼科中心及南方医院科研园区，持续提升服务能力，构筑广州东部医疗健康新高地，构建与院本部一体化高质量发展的新格局。